滨海湿地生态系统教育部重点实验室(厦门大学)(英文缩写“WEL”)是建于2007年底获得批准建设、2008年7月通过建设论证、2011年11月通过教育部验收正式运行。实验室以环境科学、水生生物学、海洋科学等国家重点学科为主要依托，学科历史悠久，在滨海湿地和海陆界面生态系研究方面具有明显的优势和特色，尤其在红树林生态学和近岸生态学领域，被国内外同行称为中国红树林研究中心和中国海洋硅藻学研究的创始地，是国内较早成立的以滨海湿地生态系统为研究对象的重点实验室。
实验室瞄准滨海湿地生态系统与全球变化的重大科学前沿，直面国家对沿海区域生态安全与环境保护的重大需求，立足基础研究和应用研究，以多学科交叉为基础，以技术创新为动力，主攻亚热带滨海湿地和海陆界面生态系统的结构、功能及环境修复，包括三个研究方向：(1)红树林湿地生态系统结构与功能及其对全球变化的响应;(2)滨海湿地环境污染、生态毒理及生物修复;(3)海陆界面生态系统演变过程与效应。
实验室已形成一支年龄结构合理、实力强劲的研究队伍，现有固定人员53人，流动人员61人(含访问学者)。拥有中科院院士2人(其中1名双聘)、国家***基金获得者3人、***特聘教授1人、国家教学名师1人，闽江学者特聘1人、厦门大学特聘教授2人、青年***计划入选者2人、教育部新(跨)世纪优秀人才人选者8人。
